PCR檢測因其高靈敏度、快速、操作方便等優勢已經被廣泛應用，不過正是由于它靈敏度*，極微量的污染源都有可能導致檢測結果的假陽性，因此所有的預防措施都會稍稍有所不同。「易查不易察」，污染來的悄無聲息，我們該如何應對。
那么，如何避免以及處理實驗室污染，對PCR人來說是一門必修課。
PCR 實驗室污染分類
1、樣本間交叉污染
主要是在采（取）樣的過程中，由于取樣工具之間的交叉造成污染；或者在核酸提取的過程中，由于移液器、離心管等使用不當導致的污染。
2、PCR試劑污染
主要是在 PCR 組分試劑加樣過程中，由于移液器、容器、陰性對照及其它試劑被核酸模板或陽性對照污染。
3、PCR擴增產物污染
這是 PCR 反應中最主要最常見的污染問題。因為 PCR 產物拷貝量大，遠遠高于 PCR 檢測數個拷貝的極限，所以極微量的 PCR 產物污染，就可形成假陽性。
還有一種容易被忽視的污染，是能造成PCR產物污染形式的氣溶膠污染，而氣溶膠造成的污染是一個值得特別重視的問題。
4、克隆質粒污染
在實驗操作中會經常用到陽性參考品，這些參考品大多數是由某些克隆質粒制作而成的，質粒在單位容積內濃度高，不小心使用極易造成污染。
實驗室污染處理方法
1.物料準備
(1).購買噴壺（能夠噴出霧狀水汽的即可）；
(2).購買市面上有效氯消毒片，根據要求配置不同濃度的消毒液，或者購買成品次氯酸鈉消毒液配制合適濃度消毒水；
(3).購買核酸氣溶膠污染清除劑(DNA AWAYO?原液/MediClean⑧稀釋100倍)；
(4).無紡布/無塵紙等。
2.應急處理方法
(1).清理廢液缸并且對廢液缸用有效氯含量為2000mg/L消毒水浸泡消除核酸污染；
(2).用有效氯含量為2000mg/L消毒水對移液槍進行擦洗，關鍵部位為移液槍前端易污染部位，清潔干凈后用潔凈水再擦拭一遍；
(3).將離心管架、擴增管架、擴增管架底板、吸嘴盒及其他相關物品用有效氯含量為500mg/L的消毒水浸泡2小時后，用清水沖洗干凈晾干后使用；
(4).對污染區域內的設備如擴增儀、全自動提取儀等，使用核酸氣溶膠污染清除劑進行反復處理；對生物安全柜等含有空氣過濾系統的設備，需更換過濾網；
(5).用有效氯含量為500mg/L的消毒液對整個實驗室（地板、墻面、天花板、門、窗戶等地方）進行清潔，并且用用有效氯含量為1000mg/L的消毒水對實驗室進行噴霧消毒（重點部位為操作區），有效降解空氣中的氣溶膠與附著在實驗臺表面的核酸污染；同時加大通風量（內循環無用，盡可能外循環）；
(6).待污染區域及設備器件清理完成后，常用設備和操作臺面使用移動紫外消毒車近距離輻照1小時；實驗室內則使用室內紫外燈整晚輻照。
以上措施每日進行，直至污染消除；步驟(1)-(6)必須堅持每天進行，確保消除實驗室污染；
3.消除污染判定標準
設計陰性對照組，根據陰性對照確認污染情況。可使用敞開后隔夜放置操作區的陰性對照進行實驗（在單獨的實驗室驗證)，若連續三天陰性對照沒有起跳，則說明污染得到控制，可恢復正常實驗。
污染，是 PCR 實驗室出現實驗假陽性、結果不可信、研發不可靠的重要推手。
在最初開展PCR實驗室的時候，應最/大程度的降低可能出現的PCR污染或杜絕污染的出現，在實驗室前期設計及日常實驗室管理和操作中，就需要進行合理的規劃以及嚴格執行實驗室SOP，把污染的可能性扼殺在搖籃中。
