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  • 上海遠慕生物科技有限公司

    逆轉錄PCR的實驗步驟
    點擊次數:943 更新時間:2023-06-29

    一、實驗器具與材料:

    1、移液槍:1ml、200μl、20μl、10μl、2μl

    2、吸頭:1ml、200μl、20μl

    3、勻漿管:5ml

    4、吸頭臺:放置1ml吸頭的一個,放置20μl吸頭的一個

    5、EP管:1.5ml、0.2ml、100μl

    6、試劑瓶:2個60ml的棕色試劑瓶(廣口,帶蓋);1個125ml的白色試劑瓶(放無水乙醇)

    7、量筒:50ml、250ml、500ml

    8、容量瓶:250ml、500ml、1000ml

    9、試管架:5ml、1.5ml、20μl

    10、鹽水瓶:250ml、500ml各2個備用,一個裝無水乙醇,另一個裝DEPC水

    11、鋁制飯盒:4個

    12、塑料小飯盒:1個

    13、大瓷缸:2個

    14、錫泊紙:一卷

    15、卷紙:2卷

    16、三角燒瓶:帶蓋,稍大

    二、實驗器具的處理與準備

    1、塑料制品:(包括槍頭、EP管、勻漿管等)
    先將DEPC水從容量瓶中倒入瓷缸中,將塑料制品逐個浸泡其中,其中小槍頭需要吸管打入DEPC水,過夜,然后高壓,再烤干備用,實驗前將槍頭等放入吸頭臺,再高壓一次(EP管)

    2、玻璃制品:泡酸過夜,沖洗干凈,蒙錫紙烤干備用(DEPC水泡)(洗凈后先泡1‰DEPC過夜,再烤干)

    3、勻漿器:(包括剪刀、鑷子)先洗凈后,再高壓(不需要泡DEPC)

    三、試劑配制:

    1、DEPC水:吸出1ml放在1000ml雙蒸水中配成1‰DEPC水,放在1000ml容量瓶中靜置4小時備用。

    2、75%乙醇:用無水乙醇 DEPC水配,然后放-20℃保存(其中DEPC水需先高壓)

    3、異丙醇:放入棕色瓶中

    4、氯仿:放入棕色瓶中

    5、瓊脂糖

    四、幾種緩沖液的配制:

    1、電泳緩沖液:
    Tris 54g
    硼酸 27.5g
    0.5M EDTA 20ml  pH8.0
    蒸溜水 1000ml
    5×TBE (貯存液)
    再將5×TBE稀釋10倍成0.5TBE就可以在電泳時使用(即工作液濃度),如取50ml貯存液 450ml水--→500ml工作緩沖液

    2、上樣緩沖液:
    0.25%溴酚藍
    0.25%二甲苯青FF
    30%甘油
    6×緩沖液,4℃保存

    五、瓊脂糖凝膠的配制:

    1、1.0%:  1.0g瓊脂糖 100ml電泳緩沖液,微波爐中火30秒至沸騰,熔化的瓊脂物冷卻至60℃時加入10mg/ml溴化乙錠2.5μl,充分混勻,將溫熱的凝膠倒入已置好梳子的膠膜中,在室溫下放置30-45min后現進行電泳。

    2、1.5%:   同上,將瓊脂糖的量改為1.5g

    六、需購置的Rt-PCR材料:

    Taq酶(含MgCl2 Buffer) 200u 70.00
    dNTP: 1支
    oligo(dT)15: 1 OD 40.00 promega
    M-MLV: 1支 250.00 promega (Buffer)
    RNasin: 1支 110
    -- -20℃
    DEPC 5g 110.00
    Trizol 100ml/1瓶 Invitrogen Life technologies
    -- 4℃
    Marker: 10μg 0.2μg/ml 150.00

    七、引物合成

    1. 正義:5′-CACGATGGAGGGGCCGGACTCATC-3′
    反義:5′-TAAAGACCTCTATGCCAACACAGT-3′

    2、par-4:
    正義:5′-GGGACCTCGGAACTCAAC-3′
    反義:5′-TGTATCTGCCTGGGACTG-3′

    3、退火溫度計算:
    2(A T) 4(G C)
    正反義平均數,再上下波動度(±4℃,或±5℃)

    4、引物各合成5 OD,每OD一瓶分裝好

    5、引物稀釋:
    加DEPC水量為(μl)= ? nmol / OD × 管上所標OD數×100
    是為10p mol / μl 濃度的引物溶液

    八、PCR產物電泳

    先將1-10μl左右PCR產物,加已點在紙上的溴酸蘭,反復吸打混勻后進行電泳,一般電流為10mA,電源100V,電泳30分鐘,紫外燈下觀察,滿意的結果掃描打印。

    九、幾個注意點:

    1、逆轉錄的關鍵步驟是立即冰水浴。

    2、Rt時,先打開PCR預熱30分鐘。

    3、RNA抽提前,打開離心機預冷。

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