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  • 上海遠慕生物科技有限公司

    植物cDNA合成的原理和操作步驟
    點擊次數(shù):261 更新時間:2025-04-11

    一、實驗目的

    掌握植物cDNA合成的原理和方法

    二、實驗原理

    反轉(zhuǎn)錄酶主要用于體外cDNA的合成。目前最chang用的反轉(zhuǎn)錄酶(reverse transcriptase)有SuperscriptII、M-MLV和AMV等。它們具有依賴于RNA或DNA的DNA聚合酶活性和RNaseH酶活性,可以以RNA分子為模板,合成出一條DNA鏈。形成的DNA是與RNA模板互補的,因而反轉(zhuǎn)錄產(chǎn)生的DNA分子稱之為cDNA。

    三、實驗材料、器具及藥品

    植物總RNA溶液。紫外分光光度計、離心機、冰盒、口罩、手套、EP管架、超凈工作臺、移液器、DEPC處理過的槍頭、EP管等。5×M-MLV RT Buffer、2.5mM dNTP mix、RNase抑制劑(30U/µL)、M-MLV Reverse Transcriptase、Oligo(dT)18 primer、無菌的DEPC水等。

    四、實驗步驟

    注意:戴手套進行以下操作,嚴防RNase污染。

    1.在超凈工作臺上吸取1ml無菌水到EP管中,加入2µl植物總RNA溶液,充分混勻,在紫外分光光度計上測定260,280nm的光吸收值(OD值),然后計算RNA的濃度,并分析其純度。

    分光光度(紫外吸收)法
    (1)預熱紫外分光光度計10—20分鐘。
    (2)取兩只比色杯,一只裝入1ml H2O溶液,作為空白溶液,用來校正分光光度計零點及調(diào)整透光度至100。
    (3)DNA純度及濃度測定:
    ①取2ul DNA或RNA樣品加入另一比色杯,加dH2O至1000ul,混勻。
    ②將兩只比色杯置分光度計中,調(diào)入射光波長,分別用空白溶液調(diào)整零點(T為100,OD為0),測定待測樣品液在260nm、280nm、230nm的OD值。
    ③計算濃度:對于雙鏈DNA 1.0 OD260=50ug/ml,
    對單鏈RNA1.0 OD260=40ug/ml。
    ④測定純度:v純的RNA溶液其OD260/OD280的比值應介于1.7至2.0,OD260/OD230的比值應大于2.0。?RNA樣品OD260/OD280的比值太小,說明有蛋白或苯ben酚污染。比值大于2.0,則可能被異硫氰酸胍污染。?OD260/OD230的比值小于2.0時表明有小分子及鹽存在。
    純的DNA溶液其OD260/OD280應為1.8,OD260/OD230應大于2.0。
    ?OD260/OD280大于1.9時,表明有RNA污染,小于1.6時表明有蛋白質(zhì)或酚污染。
    ?OD260/OD230小于2.0時,表明溶液中有殘存的鹽和小分子雜質(zhì),如核苷酸、氨基酸、酚等。

    2.在DEPC處理過的Ep管中加入約4µg總RNA和1µl 0.5µg/µl的Oligo(dT)18 primer,小心混勻,70℃保溫5分鐘,立即浸入冰水中。

    3.按次序分別加入下列試劑:
    5µl 5×M-MLV RT Buffer
    2µl dNTP mix(2.5mM)
    1µl RNase抑制劑(30U/µL)
    1µl M-MLV Reverse Transcriptase
    然后加DEPC水到25µl.

    4.小心混勻,室溫離心5秒,將所有溶液收集到管底,37℃保溫1小時。

    5.90℃處理5分鐘,冰上冷卻。

    6.用于PCR擴增或-20℃保存?zhèn)溆?

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